A proeza do piloto #93 em condições difíceis de avaliar estava de volta com um estrondo, Marquez abriu caminho até à frente para as suas primeiras vitórias consecutivas desde 2021.
O Campeão em título Francesco Bagnaia (Ducati Lenovo Team) manteve-se colado a Marquez durante grande parte da corrida, antes de se fixar no segundo lugar, uma vez que uma grande reviravolta ofereceu uma oportunidade para ganhos importantes no Campeonato: Jorge Martin (Prima Pramac Racing) arriscou a ir para as boxes, mas não valeu a pena. Ele regressou com uma volta a menos depois de ter sido forçado a trocar uma segunda vez, ficando com um ponto para o P15.
Por fim, Enea Bastianini (Ducati Lenovo Team) ficou com o último lugar na tribuna, mantendo o seu recorde de 100% de tribunas de MotoGP em Misano e ganhando terreno a Martin na classificação.
Como a chuva começou a ter um efeito visível no ritmo, havia decisões a serem tomadas. E na frente, Martin estava agora de volta ao escape de Bagnaia na liderança, com Marc Marquez a fazer grandes progressos no grupo e Jack Miller (Red Bull KTM Factory Racing) também. A caminho da entrada nas boxes na próxima ronda, houve um piloto que decidiu sair do grupo: Martin.
Quando ele entrou, Bagnaia liderou Marquez na frente, mas não por muito tempo. No final da 8ª volta, o #93 estava na liderança e Miller também estava no encalço de Bagnaia, com Martin na P15 depois de ter regressado. Mas a chuva não piorou, permitindo que Marquez e Bagnaia se afastassem quando Martin se apercebeu que teria de ir às boxes novamente.
Reaparecendo com uma volta a menos, mas logo atrás dos líderes, o objetivo de Bagnaia para fazer ganhos no Campeonato estava agora em aberto. Aqueles que apostaram – Martin, Raul Fernandez (Trackhouse Racing), Acosta depois de ter regressado, Alex Rins (Monster Energy Yamaha MotoGP Team) e Aleix Espargaro e Maverick Viñales , da Aprilia Racing, voltaram a fazer a paragem, todos fora da luta pelos pontos.
Entretanto, a chuva tinha parado, mas a diferença na frente estava a aumentar. Depois de se manter estável com Bagnaia no seu encalço, o #93 começou a afastar-se na liderança. Bastianini também estava a entrar rapidamente na luta pelo pódio, ultrapassando Miller para assumir o terceiro lugar, e Brad Binder (Red Bull KTM Factory Racing) foi o próximo a entrar em cena, ao chegar ao quarto lugar à medida que as condições melhoravam, mas como Bagnaia não conseguia fazer incursões sobre Marquez, nem Bastianini nem Binder conseguiam colmatar as respectivas diferenças.
Marquez manteve a posição vertical em grande estilo para conquistar a primeira vitória consecutiva em 2021, colocando o seu nome mais firmemente no chapéu do Campeonato e no território da Gresini. O segundo lugar de Bagnaia, no entanto, representou uma impressionante oscilação de 19 pontos no Campeonato, uma vez que a aposta de Martin saiu pela culatra – e o atual Campeão ficou suficientemente satisfeito com isso para um dia de trabalho duro sob pressão.
Atrás de Bastianini e Binder em terceiro e quarto, um duelo até ao final decidiu o quinto lugar. Depois de uma partida mais difícil da primeira linha, Marco Bezzecchi (Pertamina Enduro VR46 Racing Team) estava a recuperar e a aproximar-se de Alex Marquez (Gresini Racing MotoGP) à medida que as voltas iam passando, colando a máquina VR46 à roda traseira da frente. A manobra veio sob a forma de um mergulho por dentro na Curva 14, e Bezzecchi conseguiu manter a posição e aguentar o contra-ataque para completar os cinco primeiros.
Entretanto, Fabio Quartararo (Monster Energy Yamaha MotoGP Team) concluiu um fim de semana impressionante, com o #20 a igualar os seus melhores resultados e os da Yamaha de 2024 até ao momento, enquanto trabalham para voltar à frente. O francês duelou com Miller até à bandeirada nas últimas etapas, cortando na Curva 8 para chegar a P7. Fabio di Giannantonio (Pertamina Enduro VR46 Racing Team) e o wildcard da Red Bull KTM Factory Racing, Pol Espargaro, completaram o Top 10, com Martin a conquistar o único ponto em P15.